Razblaženi etanol najbolje antiseptičko delovanje ispoljava u koncentraciji od 70%. Povećanjem koncentracije antiseptičko dejstvo slabi. Antiseptično delovanje ostvaruje denaturacijom ćelijskih membrana.
Koristi se i za dezinfekciju radnih površina, instrumenata i kože.
Alkoholne obloge koriste se za smanjenje povišene telesne temperature.
Etanol se upotrebljava kao protivotrov kod trovanja metanolom, jer kompetitivnom inhibicijom sprečava prevođenje metanola u formaldehid i dalje do mravlje kiseline.